Το 1900, δύο μόλις χρόνια μετά την ανακήρυξη της Κρητικής Πολιτείας, διενεργήθηκε απογραφή του πληθυσμού, χωρίς αναφορές στην εθνικότητα ή στο θρήσκευμα. 

Η επαρχία Αγίου Βασιλείου προσαρτήθηκε και πάλι στο νομό Ρεθύμνου, ενώ η Βιάννος συνέχισε να υπάγεται στο νομό Λασιθίου.

 Νομός            Επαρχία          Οικισμοί     Κάτοικοι 

Χανίων          Κυδωνίας              108           43.632

                        Κισάμου               133           21.191

                        Σελίνου                  76             7.938

Σφακίων          Σφακίων               20              5.934

                      Αποκορώνου           69            19.580

Ηρακλείου       Τεμένους               40            28.335

                        Καινουργίου           56            11.032

                       Μονοφατσίου        105              9.164

                          Πεδιάδος              97            24.903

                      Πυργιώτισσας          16              5.100

                        Μαλεβιζίου             28            12.648

Ρεθύμνου        Ρεθύμνου               83            28.335

                    Αγίου Βασιλείου          41            10.256

                           Αμαρίου               39              7.943

                     Μυλοποτάμου            84            17.349

Λασιθίου      Μεραμπέλου             34             16.737

                           Σητείας                78             15.476

                         Ιεράπετρας            20               8.534

                         Λασιθίου                20               5.061

                          Βιάννου                22               7.220

 Μουσουλμανικός Πληθυσμός στην Κρήτη το 1900 

Σύνολο              Μουσουλμάνοι

303.543                 33.496

Αγροτ. Πληθ.    Μουσουλμάνοι

250.753                  6.991

Αστικ. Πληθ.    Μουσουλμάνοι

52.790                  26.505

Πηγές

Σ. Σπανάκης - Πόλεις και χωριά της Κρήτης  

Ν. Ανδριώτης Χριστιανοί και Μουσουλμάνοι στην Κρήτη 1821-1924