Υψόμ. 0 - 20
Νεότερος οικισμός, σε θέση με πιθανή κατοίκηση απο την αρχαιότητα, αφού στο δυτικό όριο του κόλπου της Αγίας Πελαγίας είχαν εντοπιστεί ίχνη της Ελληνιστικής και της Ρωμαικής περιόδου, τα οποία καλύφθηκαν απο την κατασκευή ξενοδοχείου.
Απο κάποιους αρχαιολόγους η περιοχή ταυτίζεται με την αρχαία Απολλωνία, ενώ κατα την Ενετική περίοδο χτίστηκε εδώ η Μονή της Αγίας Πελαγίας, ως μετόχι της Μονής Σαββαθιανών.
Απο την περίοδο της Κρητικής Πολιτείας μέχρι τις αρχές του Β΄ Παγκοσμίου πολέμου η Αγία Πελαγία αποτέλεσε επίνειο της Αχλάδας και των γύρω οικισμών και συνδέθηκε με το Ηράκλειο και τα υπόλοιπα λιμάνια του νησιού με πλοία της Άγονης Γραμμής Κρήτης.
Χάρτης