Στη νοτιοδυτική πλευρά του μυχού του Κόλπου Κισάμου και σε απόσταση περίπου ενός μιλίου βορειοδυτικά του Καστελίου Κισάμου, βρίσκεται το Λιμανι Καβονησιου, ή Κισαμου.
Το λιμάνι είναι κατασκευασμένο στη νότια πλευρά της Χερσονήσου Καβονήσι, που απο το δυτικό όριο του μυχού του κόλπου Κισάμου, εκτείνεται επι 3/10 του μιλίου προς βόρειοανατολικά, με μέσο πλάτος 1/10 του μιλίου.
Προστατεύεται απο ανατολικά με λιμενοβραχίονα νότιας-νοτιοανατολικής κατεύθυνσης μήκους 400 μέτρων και απο νότια με λιμενοβραχίονα ανατολικής-βορειοανατολικής κατεύθυνσης, μήκους 70 περίπου μέτρων, ενώ η είσοδος του έχει άνοιγμα 130 μέτρων.
Η είσοδος του λιμανιού, φωτοσημαίνεται απο δύο φανούς στις άκρες των δύο λιμενοβραχίονων.
Στο άκρο το βορειοανατολικού λιμενοβραχίονα:
Σχήμα 21 του Φ.Ε.Α.
Στίγμα Περίοδος Ύψος Φωτοβολία Χαρακτηριστικά
Β 35ο 31' 0'' Αν Πρασ. 2'' 7 μέτρα 3 μίλια. Σιδηρόπλεκτος Οβελός με εξώστη και
Α 23ο 38' 5'' 0,3 + 2,7 = 3'' μεταλλική στήλη με πράσινη οριζόντια λουρίδα
Στο άκρο του νοτιοδυτικού λιμενοβραχίονα:
Σχήμα 21 του Φ.Ε.Α.
Στίγμα Περίοδος Ύψος Φωτοβολία Χαρακτηριστικά
Β 35ο 31' 0'' Αν Ερυθ. 3'' 9 μέτρα 3 μίλια Σιδηρόπλεκτος Οβελός με εξώστη και
Α 23ο 38' 3'' 0,3 + 2,7 = 3'' μεταλλική στήλη με ερυθρά οριζόντια λουρίδα.
Μεγάλο μέρος των δυτικών ακτών του λιμένα δεν είναι ακόμα κρηπιδωμένο, ενώ οι εργασίες συνεχίζονται κατα διαστήματα.
Το εσωτερικό του λιμένα δεν είναι πλήρως υδρογραφημένο. Αβαθή στη νοτιοδυτική πλευρά του, κάνουν δύσκολους τους χειρισμούς μεγάλων πλοίων, ιδιαίτερα κατα τη διάρκεια ισχυρών ανέμων.
Γενικά το λιμάνι Κισάμου θεωρείται ασφαλές με ανέμους μέτριας έντασης. Με ισχυρούς βόρειους ανέμους, το ύψος του κύματος μέσα στο λιμάνι, μπορεί να ξεπεράσει τα 1,5 μέτρα.
Το λιμάνι Κισάμου στις αρχές της δεκαετίας του ΄70, με το
''Κανάρης'' πλαγιοδετημένο στον υπο κατασκευή ακόμα
τότε λιμενοβραίονα. (Φώτο: Ανυφαντής)
Στη δυτική πλευρά του λιμανιού υπάρχει κεκλιμένο επίπεδο και ανυψωτικά μηανήματα, ενώ υπάρχει η δυνατότητα επισκευών στο καρνάγιο που λειτουργεί μέσα στο λιμάνι.
Υπάρχει μόνιμη παροχή νερού, ενω ο ανεφοδιασμός καυσίμων γίνεται με βυτία.
Στο λιμάνι Κισάμου, το 1975 (Φώτο Ανυφαντής)
Στο λιμάνι λειτουργεί Τελωνειακος σταθμός, Λιμενική Αρχή και Αστυνομικός σταθμός, ενω η εποικοινωνία των πλοίων γίνεται απο το κανάλι 12 του VHF.
Το λιμάνι Κισάμου, συνδέει τη δυτική Κρήτη με την Πελοπόνησο και τα Κύθηρα και Αντικύθηρα, ενώ εκτελούνται και καθημερινά δρομολόγια τουριστικών πλοίων προς τη Γραμβούσα και τον Μπάλο.